Hoehenried

Herbstschule
"Reproduzierbare Forschung & Software-Validierung"

im Rahmen der Sommerschulen der Internationale Biometrischen Gesellschaft (Deutsche Region).

Tagungszentrum Schloß Höhenried
10.-12. November 2008

Veranstalter: Prof. Friedrich Leisch, LMU München

Inhalte - Dozenten - Programmtafel - Software - NEU: Unterlagen

Inhalte

  • Allgemeine Grundlagen der Reproduzierbarkeit computationaler Forschungsergebnisse, Reproduzierbarkeit in der Biostatistik und im biostatistischen Consulting
  • Einbettung von Programmcode in statistische Analysen und Dokumente (Sweave, SASweave)
  • Qualitätssicherung bei statistischer Software: Unit Tests, Regressionstests, funktionale Tests, gute Praktiken bei Software-Design und -Entwicklung zur Unterstützung von Tests
  • Validierung und Einhaltung von Auflagen der Kontrollbehörden ("FDA regulatory compliance")
  • Open Sourve vs. kommerzielle Software: Einsatz an Universitäten und in der Industrie
  • Beispiele in R und SAS

Dozenten

  • Dr. Søren Højsgaard, Institut für Genetik und Biotechnologie, Universität Aarhus, Dänemark
  • Prof. Torsten Hothorn, Institut für Statistik, LMU München
  • Prof. Friedrich Leisch, Institut für Statistik, LMU München
  • Prof. Anthony Rossini, Novartis Pharma AG, Basel, Schweiz,
    und Department of Medical Education and Biomedical Informatics, University of Washington, USA

Programmtafel

Mo, 10.11.10:30-10:40L. Hothorn Begrüßung durch Präsident DR-IBS
10:40-11:00F. Leisch Vorstellung Dozenten und Teilnehmer, thematische Einleitung
11:00-12:30A. Rossini Regulatory Computing in Pharma (VO)
12:30-14:00 Mittagessen
14:00-15:00A. Rossini Regulatory Computing in Pharma (UE)
15:00-16:00A. Rossini Workflows for Statistical Practice (VO + UE)
16:00-16:30 Pause
16:00-18:30A. Rossini Workflows for Statistical Practice (VO + UE)
19:00-20:30 Abendessen
Di, 11.11.9:00-11:00T. Hothorn Qualitätssicherung bei statistischer Software
11:00-11:30 Pause
11:30-13:00T. Hothorn Qualitätssicherung bei statistischer Software
13:00-14:00 Mittagessen
14:00-16:00 Bei Schönwetter: Spaziergang am Starnberger See
16:00-16:30 Kaffee & Kuchen
16:30-18:30F. Leisch Reproduktion statistischer Analysen (UE)
19:00-20:30 Abendessen
Mi, 12.11.9:00-10:30 F. Leisch
S. Højsgaard
Werkzeuge für reproduzierbare statistische Analysen (VO)
10:30-11:00 Pause
11:00-12:30S. Højsgaard Statweave for Openoffice (UE)
12:30-14:00 Mittagessen
14:00-16:00F. Leisch Sweave Tipps & Tricks

Software

  • R (Version ≥ 2.7.1)
  • Werkzeuge zum Installieren von R-Pakete aus Sourcen:
    • Linux: Da sollte normalerweise alles da sein, auf Debian-basierten Distributionen (Debian, Ubuntu, ...) kann dies z.B. mittels "apt-get install r-base-dev" sichergestellt werden.
    • Mac OS X: siehe Mac OS X FAQ
    • Windows: Rtools
  • Je nach Präferenzen und Vorkenntnissen zur Textverarbeitung OpenOffice und/oder LaTeX.
  • SASweave, StatWeave